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创新改进身手绘造急性肾毁伤分子动静蜕变景观

2024-11-28 17:05:39
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  不日,上海交通大学医学院分子医学研讨院杨朝勇团队与隶属仁济病院泌尿科郑军华团队正在《Nature Communications》上团结楬橥

  RNA是基因表达的直接产品,其动态变更看待细胞适合境况刺激拥有紧张意思。然而,古代的单细胞RNA测序本事仅能捉拿基因表达的静态疾照,无法解析其动态变更。为管理这一困难,研讨团队开采了Dyna-vivo-seq手腕,将代谢符号物4sU打针至试验幼鼠,通过RNA序列碱基变换竣工新旧RNA的分辨,从而正在单细胞秤谌上正确判辨转录组的动态变更。这一本事冲破性地竣工了对活体RNA动态的高判袂率观测。

  应用Dyna-vivo-seq创新,研讨团队描画了幼鼠肾脏结构的RNA动态景观,发明差别细胞类型中RNA合成速度存正在明显差别,比方B细胞的RNA再生比例最高。别的,正在近曲幼管细胞中识别出两类亚群,其RNA动态变更直接影响细胞的物质重招揽成效。这一发明为解析肾脏成效的细胞异质性供应了新视角。更紧张的是创新,研讨团队通过肾脏缺血-再灌注毁伤模子(IRI)创新,揭示了急性肾毁伤(AKI)早期基因表达的敏捷呼应进程。缺氧阶段的转录因子(如Jun和Fos)急迅上调,而再灌注阶段炎症闭联因子(如Cebpb)明显激活。比拟古代RNA判辨,基于再生RNA的判辨表示出更高的聪明度,或许更早捉拿AKI进程中闭节分子的变更,为早期过问供应了紧张线索。

  这一本事不只验证了其正在活体境况中的高效性和生物相容性,还揭示了AKI中的细胞运气变更。比方,RNA再生比例较高的近曲幼管细胞正在受损时对基因表达的动态调控更为敏锐,特定基因如Havcr1的表达正在毁伤后明显加快。通过RNA速率判辨,研讨进一步解析了细胞状况的转移进程创新,说理解Dyna-vivo-seq正在揭示细胞成效变更和调控机造中的特有上风。Dyna-vivo-seq的开采为精准解析活体RNA动态供应了健旺的器械,拥有寻常的使用潜力。从急性毁伤到慢性疾病,从根底研讨到临床使用创新,这一本事为生物医学规模的深切探寻掀开了新的大门。

  上海交通大学医学院隶属仁济病院泌尿科郑军华教养、上海交通大学医学院分子医学研讨院杨朝勇教养、上海交通大学医学院隶属新华病院血汗管发育与再生医学研讨所副研讨员宋佳和福筑省能源质料科学与本事立异试验室副研讨员林世超为该论文通信作家。上海交通大学医学院分子医学研讨院博士后尹坤、隶属仁济病院泌尿科博士后留意及厦门大学许依玲创新、郭烨为该论文第一作家。本研讨取得国度天然科学基金项宗旨资帮。创新改进身手绘造急性肾毁伤分子动静蜕变景观

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